بدأت فترة رئاسة أبراهام لينكون بتاريخ 4 مارس 1861، حيث نُصّب رئيس الولايات المتحدة السادس عشر، وانتهت باغتياله ووفاته في 15 أبريل 1865، أي بعد مرور 42 يومًا من بداية ولايته الثانية. لينكون هو أول عضو يُنتخب للرئاسة في الحزب الجمهوري المؤسس حديثًا. خلفه نائب الرئيس أندرو جونسون. أشرف لينكون على انتصار الاتحاد في الحرب الأهلية الأمريكية، التي سادت أثناء رئاسته.
تولى لينكون الرئاسة في أعقاب الانتخابات الرئاسية لعام 1860، والتي فاز فيها بأغلب الأصوات الشعبية ضد أربعة مرشحين. معظم الأصوات لصالح لينكون كانت من شمال الولايات المتحدة، بينما لم يحظَ الجمهوريون بالكثير من دعم الناخبين في جنوب الولايات المتحدة. كان لينكون عضوًا سابقًا في حزب اليمين السابق، وعمل على منصة سياسية معارضة لتوسيع العبودية في المنطقة. مثّل انتخابه شرارة لاندلاع الحرب الأهلية. بعد أن أدى اليمين الرئاسية، رفض لينكون قبول أي قرار من شأنه أن يؤدي إلى انفصال الجنوب عن الاتحاد. اندلعت الحرب الأهلية في غضون أسابيع من بداية رئاسة لينكون مع الهجوم الكونفدرالي على حصن سمتر، وهي منشأة فيدرالية تقع ضمن حدود الكونفدرالية.
أهاب لينكون بالتعامل مع جميع الجوانب السياسية والعسكرية للحرب الأهلية، ومواجهة التحديات في كلا المجالين. بصفته القائد العام، أمر بتعليق حق الحماية الدستورية في المثول أمام القضاء في ولاية ميريلاند من أجل قمع مؤيدي الكونفدراليين. أصبح كذلك أول رئيس يضع أجندة عسكرية. واجه الاتحاد العديد من الهزائم المبكرة في المناطق الشرقية أثناء الحرب الأهلية الأمريكية، عيّن لينكون خلال الحرب العديد من القادة العسكريين، واستقر أخيرًا على الجنرال يوليسيس جرانت، الذي قاد الاتحاد إلى عدة انتصارات في المناطق الغربية. ساهم إعلان تحرير العبيد الذي أصدره لينكون عام 1863 في إطلاق سراح نحو 20,000 من العبيد في الأراضي الخاضعة لسيطرة الكونفدرالية، وأرسى التحرر هدفًا من أهداف حرب الاتحاد. في عام 1865، نشط لينكون في إقرار التعديل الثالث عشر للدستور، والذي نص على عدم شرعية العبودية. أشرف لينكون كذلك على إصدار تشريع محلي هام، بما في ذلك القانون الأول من مراسيم الحيازة الزراعية وقانون منح الأراضي في موريل لعام 1862 وقانون السكك الحديدية في المحيط الهادئ لعام 1862. ترشح لينكون لإعادة انتخابه في عام 1864 نيابة عن الاتحاد الوطني، الذي دعمه ديمقراطيو الحرب بالإضافة إلى الجمهوريين. على الرغم من خشية لينكون عدم الفوز بالمنافسة، هزم تابعه السابق، الجنرال جورج برينتون ماكليلان، بفوز ساحق. بعد مرور أشهر على الانتخابات، ضمن لينكون إنهاء الحرب بهزيمة الجيش الكونفدرالي بقيادة الجنرال روبرت لي. اغتيل لينكون في أبريل 1865، بعد خمسة أيام من استسلام لي القيادة، تاركًا التحدي النهائي لإعادة بناء الدولة على كاهل آخرين.
بعد وفاة لينكون، وُصِف بأنه محرر العبيد ومنقذ الاتحاد وشهيد قضية الحرية. كان المؤرخون السياسيون يقدرون لينكون لإنجازاته وصفاته. صنّف العلماء والجمهور لينكون ضمن أعظم ثلاثة رؤساء للولايات المتحدة، إلى جانب جورج واشنطن وفرانكلين روزفلت، وصُنّف في كثير من الأحيان في المرتبة الأولى.