الخفاشيات هي مصدر الغذاء للبشر في بعض المناطق. يتم استهلاك الخفافيش بكميات مختلفة في بعض المناطق داخل الصين، وفيتنام، وسيشيل، وإندونيسيا، وبالاو، وغوام، وفي بعض دول وثقافات إفريقيا وآسيا والمحيط الهادئ. في غوام، تُعتبر خفافيش فاكهة ماريانا (Pteropus mariannus) من الأطعمة الفاخرة.
كما تم تناول الخفافيش في أجزاء من أوروبا والشرق الأوسط في الماضي بدرجة أقل. لا تزال الخفافيش تؤكل في أجزاء من إفريقيا، حيث يتم مداهمة الكهوف لصيدها.
يقول إصدار عام 1999 من The Oxford Companion to Food أن نكهة خفافيش الفاكهة تشبه نكهة الدجاج، وأنها «حيوانات نظيفة تقتات حصرياً على الفاكهة». قد تطبخ الخفافيش بعدة طرق، مثل الشواء، الباربكيو، القلي العميق، أو القلي السريع. في حالة القلي العميق، يمكن طهي الخفافيش بالكامل وتناولها.
أثناء الطهي، قد تنبعث من الخفافيش روائح قوية شبيهة بالبول والبراز. يمكن تقليل ذلك عن طريق إضافة الثوم والبصل والفلفل الحار أو البيرة أثناء الطهي.