السفارة البابوية في قطر هي البعثة الكنسية التابعة للكنيسة الكاثوليكية في قطر، كما تمثل البعثة الدبلوماسية للكرسي الرسولي لدى الدولة. ويُعرف ممثلها الدبلوماسي باسم السفير البابوي.
ويتولى السفير البابوي لدى الكويت، المقيم في مدينة الكويت، مهام السفير البابوي لدى قطر أيضاً.
قبل إقامة العلاقات الدبلوماسية بين الكرسي الرسولي وقطر، مثّل الكرسي الرسولي مصالحه في الدولة من خلال بعثات ذات اختصاصات إقليمية. وكانت أولى هذه البعثات الوفد الرسولي إلى منطقة البحر الأحمر، الذي أنشأه البابا بولس السادس في 3 يوليو 1969، ثم الوفد الرسولي إلى شبه الجزيرة العربية، الذي أنشأه البابا يوحنا بولس الثاني في 26 مارس 1992.
وأقام الكرسي الرسولي وقطر علاقات دبلوماسية رسمية في 18 نوفمبر 2002.