خريطة الاقتطاع (الإنجليزية: Restriction map) هي خريطة لمواقع الاقتطاع المعروفة ضمن تسلسل من الحمض النووي. يتطلب تعيين الاقتطاع استخدام إنزيمات الاقتطاع. في علم الأحياء الجزيئي، تستخدم خرائط الاقتطاع كمرجع لهندسة البلازميدات أو غيرها من القطع القصيرة نسبياً من الحمض النووي، وأحياناً للحمض النووي الجينومي الأطول. هناك طرق أخرى لتعيين المعالم على الحمض النووي لجزيئات الحمض النووي ذات الطول الأطول، مثل رسم الخرائط عن طريق التنبيغ.
تتمثل إحدى الطرق في بناء خريطة اقتطاع لجزيء الحمض النووي في تسلسل الجزيء بأكمله وتشغيل التسلسل من خلال برنامج كمبيوتر سيجد مواقع التعرف الموجودة لكل إنزيم اقتطاع معروف.
قبل أتمتة التسلسل، كان من المكلف للغاية تسلسل شريط الحمض النووي بأكمله. للعثور على المواضع النسبية لمواقع الاقتطاع على البلازميد، تُستخدم تقنية تتضمن هضم اقتطاع مفرد ومزدوج. بناء على أحجام شظايا الحمض النووي الناتجة، يمكن استنتاج مواقع المواقع. يعد تعيين الاقتطاع تقنية مفيدة للغاية عند استخدامها لتحديد اتجاه الإدراج في متجه الاستنساخ، عن طريق تعيين موضع موقع اقتطاع خارج المركز في الإدخال.