تساعد الخرائط الجينية في وصف ترتيب أماكن الجينات على الكروموسوم حيث يتم تعيين الجينات في موقع معين على كروموسوم يُعرف بالموقع ويمكن استخدامه ك
كمؤشرات جزيئية لإيجاد المسافة بين الجينات الأخرى على الكروموسوم. توفر الخرائط الفرصة للباحثين للتنبؤ بأنماط الوراثة لصفات محددة، والتي يمكن أن تؤدي في النهاية إلى فهم أفضل للصفات المرتبطة بالأمراض.