ينص الدستور على حرية الاعتقاد ومبدأ الفصل بين الكنيسة والدولة؛ ومع ذلك، استمرت الحكومة في تقييد هذه الحقوق عمليًا. تسمح الحكومة بعمل ما تعتبره الجماعات الدينية السائدة، بما في ذلك الجماعات الإسلامية المعتمدة والجماعات اليهودية والكنيسة الأرثوذكسية الروسية والعديد من الطوائف المسيحية الأخرى، مثل: الروم الكاثوليك واللوثريين والمعمدانيين. يتسامح المجتمع الأوزبكي عمومًا مع الكنائس المسيحية طالما أنها لا تحاول الفوز بالمتحولين من بين الأوزبك العرقيين؛ يحظر القانون أو يقيد بشدة أنشطة: مثل: التبشير واستيراد ونشر الأدب الديني وتقديم التعليم الديني الخاص.
ظل وضع حرية الاعتقاد مقيدًا مع انخفاض محدد لبعض جماعات الخمسينية وغيرها من الجماعات المسيحية خلال فترة هذا التقرير. استمر عدد من مجموعات الأقليات الدينية، بما في ذلك تجمعات بعض الطوائف المسيحية، العمل دون تسجيل لأنها لم تفِ بشروط التسجيل الصارمة المنصوص عليها في القانون. كما هو الحال في الفترات السابقة، أفادت مجموعات بروتستانتية ذات أعضاء أوزبكيين عرقيين بأنها تعمل في مناخ من المضايقة والخوف. باستخدام قوانين جنائية جديدة سُنت في عام 2006، وجهت الحكومة تهم جنائية ضد اثنين من القساوسة. حُكم على أحدهم بأربع سنوات في معسكر العمل؛ تلقى الآخر عقوبة مع وقف التنفيذ ووضعه تحت المراقبة. قام موظفو تطبيق القانون بمداهمة ومضايقة بعض الجماعات غير المسجلة، واحتجازهم وتغريم قادتهم وأعضائهم. استمرت الحكومة في حملتها ضد الجماعات الإسلامية غير المصرح بها المشتبه في آرائها أو أنشطتها المتطرفة، واعتقلت العديد من الأعضاء المزعومين في هذه الجماعات وحكمت عليهم بالسجن لفترات طويلة. كان العديد من هؤلاء يُشتبه في أنهم أعضاء في حزب التحرير، وهي حركة سياسية إسلامية متطرفة محظورة، أو جماعة أكروميا الإسلامية المحظورة أو الجماعات »الوهابية« غير المحددة. لم تتعرض الحكومة بشكل عام للمصلين الذين يذهبون إلى المساجد المُرخصة ومنحت الموافقات على مواد إسلامية جديدة مطبوعة وصوتية ومرئية. يعمل عدد قليل من المساجد »السرية« تحت المراقبة الدقيقة للسلطات الدينية وأجهزة الأمن.
تتمتع الجماعات الدينية بعلاقات متسامحة عمومًا؛ ومع ذلك، استمر الجيران والأسرة وأصحاب العمل في كثير من الأحيان في الضغط على المسيحيين من أصل أوزبكي، وخاصة المتحولين حديثًا وسكان المجتمعات الصغرى. كانت هناك عدة تقارير عن خُطب ضد المبشرين والأشخاص الذين تحولوا عن الإسلام. تعرض شماس تابع لحركة الخمسينية للضرب المبرح بعد ظهور كنيسته بشكل بارز في فيلم وثائقي بثه التلفزيون الحكومي ضد الإنجيليين المسيحيين. على عكس الفترات السابقة، كان هناك تقرير واحد فقط عن الأفراد المتهمين بتوزيع منشورات حزب التحرير، والتي تحتوي غالبًا على خطاب قوي معادِ للسامية، خلال فترة هذا التقرير.