إمدادات المياه والصرف الصحي في إندونيسيا يتميز بمستوى رديء من درجات الوصول وجودة الخدمة. يفتقر أكثر من 40 مليون شخص إلى مصدر مياه محسّن ولا يستطيع أكثر من 110 ملايين من سكان البلاد البالغ عددهم 240 مليون نسمة الحصول على خدمات الصرف الصحي المحسنة. فقط حوالي 2 ٪ من الناس يمكنهم الوصول إلى الصرف الصحي في المناطق الحضرية، هذا هو واحد من أدنى المعدلات في العالم بين البلدان المتوسطة الدخل. تلوث المياه واسع الانتشار في بالي وجاوة. أفادت النساء في جاكرتا بإنفاق 11 دولارًا أمريكيًا شهريًا على الماء المغلي، مما يعني عبئًا كبيرًا على الفقراء.
لم يكن المستوى المقدر للاستثمارات العامة البالغ 2 دولار أمريكي للفرد في العام في عام 2005 كافياً لتوسيع الخدمات بشكل كبير والحفاظ على الأصول بشكل صحيح. علاوة على ذلك فإن مسؤوليات السياسة مجزأة بين الوزارات المختلفة. منذ بدء تطبيق اللامركزية في إندونيسيا في عام 2001 اكتسبت الحكومات المحلية (المناطق) المسؤولية عن إمدادات المياه والصرف الصحي. ومع ذلك لم يترجم هذا حتى الآن إلى تحسين جودة الخدمة أو الوصول إليها، ويرجع ذلك أساسًا إلى أن نقل المسؤوليات لم يتبعه آليات توجيه أموال كافية للقيام بهذه المسؤولية. لا تزال المرافق المحلية ضعيفة.
للأسف لم يتم اعتبار توفير مياه الشرب النظيفة كأولوية تنموية، ولا سيما على مستوى حكومة المقاطعة. لا يزال الافتقار إلى المياه النظيفة والصرف الصحي يمثل تحديا خطيرا، وخاصة في الأحياء الفقيرة والمناطق الريفية. هذا مصدر قلق كبير لأن نقص المياه النظيفة يقلل من مستوى النظافة في المجتمعات ويؤدي أيضًا إلى زيادة احتمال إصابة الأشخاص بأمراض جلدية أو غيرها من الأمراض التي تنقلها المياه. أدى الفشل في تعزيز التغيير السلوكي بقوة، لا سيما بين الأسر ذات الدخل المنخفض وسكان الأحياء الفقيرة، إلى تفاقم الأثر الصحي لحالة المياه والصرف الصحي في إندونيسيا.