يهودية الهيكل الثاني هي اليهودية، أو الديانة اليهودية كما تطوّرت خلال فترة الهيكل الثاني، التي بدأت مع تشييد الهيكل الثاني نحو عام 516 قبل الميلاد وانتهت بتدمير القدس سنة 70 م. وقد تميّزت هذه الفترة بظهور تيارات دينية متعددة، إلى جانب تطورات ثقافية ودينية وسياسية واسعة بين اليهود. وشهدت هذه الحقبة تقدّم تقنين أسفار الكتاب المقدس العبري، وظهور الكنيس، وتبلور مفاهيم علم الآخرات اليهودي. كما بدأ صعود المسيحية في السنوات الأخيرة من فترة الهيكل الثاني.
وفقًا للتقاليد اليهودية، فإن النبوة الأصيلة، قد توقّفت خلال السنوات الأولى من فترة الهيكل الثاني؛ مما ترك اليهود دون صورتهم الخاصة من الإرشاد الإلهي في وقت كانوا يشعرون فيه بأمسّ الحاجة إلى الدعم والتوجيه. وفي ظل الحكم الهلنستي، أصبح تزايد تأثّر اليهودية بالهلنستية مصدر استياء بين التقليديين اليهود الذين تمسّكوا بعقائد التوحيد الصارم. وكان الاعتراض على التأثير الهلنستي في الممارسات الدينية والثقافية اليهودية عاملًا رئيسيًا في اندلاع ثورة المكابيين ضد الإمبراطورية السلوقية. وبعد قيام السلالة الحشمونية، أعاد المكابيون ترسيخ اليهودية التقليدية في أنحاء أرض إسرائيل مع توسّع إقليمهم المستقل. وشهدت السنوات اللاحقة من فترة الهيكل الثاني تطوّر عدة أفكار مسيانية يهودية. ومنذ 170 ق.م حتى 30 م، تعاقبت خمس أجيال من الزوغوت على قيادة الشؤون الروحية لليهود.
وشهدت أواخر فترة الهيكل الثاني ظهور عدة مدارس أو جماعات يهودية. فقد كان الفريسيون جماعة مؤثرة ضمّت أعضاء من الكهنوت ومن عامة الشعب، وآمنوا بأن التوراة المكتوبة والتقاليد الموروثة متساويتان في الإلزام. أما الصدوقيون، الذين تألفوا من كبار الكهنة والأرستقراطيين، فقد رفضوا عقيدة قيامة الأموات. وانتقد الأسينيون ممارسات الهيكل، معتبرين الكهنة غير شرعيين والطقوس معيبة، وتوقّعوا انتصار الخير على الشر، واختار بعضهم العيش في عزلة. ومع ذلك، فإن معظم اليهود لم ينتموا إلى أي جماعة بعينها، بل مارسوا تقاليد عامة مثل حفظ السبت، والاحتفال بالأعياد، وحضور الكنيس، وأداء الحج إلى الهيكل، واتباع قوانين الطعام، وختان مواليدهم الذكور.
وبعد تدمير الهيكل سنة 70 م، تحوّلت اليهودية بعيدًا عن الطقوس المرتبطة بالهيكل، بما في ذلك العبادة القربانية، وتكيّفت مع إطار جديد من دون مركزها المقدّس. واختفت الطائفية اليهودية، بينما برز الفريسيون، الذين خلفهم لاحقًا الحاخامات، بوصفهم القوة القيادية. وتركّز هذا التحوّل على الالتزام بالتوراة، والأعمال الأخلاقية، والصلاة الجماعية، والشريعة الحاخامية، مما أفضى إلى نشوء اليهودية الحاخامية، التي أصبحت الشكل السائد لليهودية منذ أواخر العصور القديمة.
شهدت فترة الهيكل الثاني اضطرابات مهمة وتغيرات دينية أثرت على الديانتين اليهودية والمسيحية. يسمي المسيحيون هذه الفترة بفترة بين العهدين. وانطبعت هذه الفترة بتطور مفاهيم دينية أساسية مثل سلطة الكتاب المقدس ومركزية القانون والأخلاق الدينية ودور الكنيس وأفكار نهاية الكون الحتمية. نشأت المسيحية المبكرة في إطار اليهودية في فترة الهيكل الثاني، وذلك خلال القرن الأول، وكان الفارق الجوهري بين اليهودية والمسيحية اليهودية هو الإيمان المسيحي بأن يسوع هو المسيح اليهودي الذي قام من بين الأموات. وتُعرَف اليهودية بإتاحتها تصور وجود أكثر من شخصية مسيانية واحدة، وأبرز هاتين الشخصيتين هما المسيح بن يوسف والمسيح بن داود.