ناعومي أمير (بالعبرية: נעמי עמיר) هي طبيبة إسرائيلية، ولدت في 23 يناير 1931 في شيكاغو بالولايات المتحدة وتوفيت في 4 يناير 1995 في القدس في إسرائيل.
بعد حصولها على شهادة الطب من جامعة نيويورك عام 1952 عملت كطبيبة مقيمة في مركز هاواسا العبري الجامعي في أورشليم، واختارت التخصص في علم الأعصاب الخاص بالأطفال، والذي كان جديدا في إسرائيل وقتها، ثم أسست أول عيادة تخصصية في الدولة عام 1968 ضمن مستشفى بيكور-هوليم، بعد ذلك وسعت العيادة إلى مركز تشخيصي وعلاجي وتطويري كامل. انتقلت ناعومي مع فريقها عام 1990 إلى مركز شار-زيداك الطبي، وتعتبر مؤسسة لعلم أعصاب الأطفال الحديث في إسرائيل.