مكاريوس الثاني ((بالإغريقية: Πατριάρχης Μακάριος Β΄)، (باللاتينية: Macarius II)؛ توفي في 574/575) — بطريرك القدس للروم الأرثوذكس؛ تولى الكرسي البطريركي مرتين: الأولى لمدة شهرين بدأت من أكتوبر عام 552 م، والثانية في الفترة ما بين عامي 563/564 و574/575 م. وقد مرت فترة بطريركيته خلال النصف الثاني من عهد الإمبراطور جستينيان الأول، إبان الصراع العنيف حول عقيدة طبيعة المسيح (الكريستولوجيا).
من المحتمل أن يكون تذكار مكاريوس الثاني بالذات هو ما يُحتفل به في 16 أغسطس في التقويم الفلسطيني-الجرجي، على الرغم من أنه من المرجح أن يكون هذا الاحتفال متعلقاً بـ مكاريوس الأول (أسقف القدس).