المعلوماتية الحيوية الهيكلية (التركيبية) هي فرع المعلوماتية الحيوية الذي يعنى بتحليل وتوقع التركيب ثلاثيّ الأبعاد للجزيئات الكبيرة الحيوية مثل: البروتينات، ال ار ان ايه وال دي ان ايه.
تتعامل مع تعميمات حول الشكل ثلاثي الأبعاد للجزيئات الكبيرة مثل مقارنة إجمالي الطيات والأنماط المحلية، مبادئ حدوث الطيات، التطور، تفاعلات تكوين الروابط، وعلاقات التركيب\الوظيفة، معتمدة على التراكيب التي تم الكشف عنها تجريبياً وعلى النماذج الحاسوبية.
مصطلح «هيكلية» له نفس دلالة المصطلح في «العلوم الحيوية الهيكلية (التركيبية)», ويمكن اعتبار المعلوماتية الحيوية الهيكلية كجزء من العلوم الحيوية الهيكلية المحوسبة.