يُقصد بمذبحة فوكوفار، والمعروفة أيضا باسم مذبحة مستشفى فوكوفار أو مذبحة أوفتشارا، قتل القوات شبه العسكرية الصربية لأسرى الحرب والمدنيين الكرواتيين، الذين سلمهم الجيش الشعبي اليوغوسلافي، في مزرعة أوفتشارا جنوب شرق فوكوفار، في 20 نوفمبر 1991، خلال حرب الاستقلال الكرواتية. وقعت المذبحة بعد وقت قصير من استيلاء الجيش الشعبي اليوغوسلافي، وقوات الدفاع الإقليمي، والقوات شبه العسكرية من صربيا المجاورة، على فوكوفار. تُعد مذبحة فوكوفار أكبر مذبحة في حرب الاستقلال الكرواتية.
جرى التفاوض بين السلطات الكرواتية والجيش الشعبي اليوغوسلافي وبعثة الرصد التابعة للجماعة الأوروبية بالتعاون مع اللجنة الدولية للصليب الأحمر، في الأيام الأخيرة من المعركة، على إخلاء مستشفى فوكوفار. رفض الجيش الشعبي اليوغوسلافي لاحقًا دخول اللجنة الدولية للصليب الأحمر إلى المستشفى رغم الاتفاق، وأخرج ما يقرب من 300 شخص من مباني المستشفى. نُقلت المجموعة، التي كان معظمها من الكروات بجانب عدد من الصرب والمجريين والمسلمين واثنين من الرعايا الأجانب الذين قاتلوا إلى جانب الحرس الوطني الكرواتي، في البداية إلى ثكنات الجيش الشعبي اليوغوسلافي في فوكوفار. تبين أن عدد من السجناء من موظفي المستشفى، فجرى عزلهم من المجموعة لإعادتهم إلى المستشفى، في حين نُقل بقيتهم إلى مزرعة أوفتشارا جنوب فوكوفار. تعرض السجناء، عند وصولهم إلى المزرعة، للضرب لعدة ساعات، قبل أن يسحب الجيش الشعبي اليوغوسلافي قواته من الموقع، تاركينهم في عهدة قوات الدفاع الإقليمي الصربية الكرواتية والقوات شبه العسكرية الصربية. نُقل السجناء بعد ذلك إلى موقع جاهز، وأُطلق النار عليهم في مجموعات من عشرة إلى عشرين، ودُفنوا في مقبرة جماعية.
اكتُشفت المقبرة الجماعية في أكتوبر 1992، وقامت بحراستها قوة الحماية التابعة للأمم المتحدة التي نُشرت في المنطقة في وقت سابق من ذلك العام. استخرج محققو المحكمة الجنائية الدولية ليوغوسلافيا السابقة، في عام 1996، 200 مجموعة من رفات القبر. تعتقد كرواتيا أن 61 شخصًا آخرين دفنوا في مقبرة أخرى بالموقع، بينما يعتقد ممثلو إدعاء المحكمة الجنائية الدولية ليوغوسلافيا السابقة أنهم 60 شخصًا فحسب. أدانت المحكمة الجنائية الدولية ليوغوسلافيا السابقة اثنين من ضباط الجيش الشعبي اليوغوسلافي كانا على صلة بالمذبحة، وحاكمت كذلك الرئيس الصربي السابق سلوبودان ميلوشيفيتش على عدد من جرائم الحرب، ومنها تلك التي ارتُكبت في فوكوفار. تُوفي سلوبودان ميلوشيفيتش في السجن قبل انتهاء محاكمته. حاكم القضاء الصربي العديد من الأعضاء السابقين في قوات الدفاع الإقليمي الصربية الكرواتية والوحدات شبه العسكرية الصربية، وأدانهم لتورطهم في المذبحة. قضت محكمة العدل الدولية، في فبراير 2015، بأن الحصار والمذابح والفظائع المتزامنة التي ارتُكبت في أماكن أخرى في كرواتيا لا تشكل إبادة جماعية.
مُيز موقع المقبرة الجماعية بنصب تذكاري، وأُعيد بناء أرضية مبنى مزرعة أوفتشارا، التي استُخدمت لإيداع السجناء في الأسر، كمركز تذكاري في عام 2006. زار المركز، بحلول يوليو 2014، نحو 500,000 سائح.