مذبحة بوناري أو مذبحة بانيرياي هي مجزرة جماعية أسفرت عن مقتل 100,000 شخص، معظمهم من اليهود والبولنديين والروس على يد الشرطة الأمنية الألمانية والوحدة الوقائية والمتواطئين معهم من الليتوانيين، من ضمنهم فرقة القتل الليتوانية اليباتينغاسيس بوريس، خلال الحرب العالمية الثانية والهولوكوست في مفوضية الرايخ أوستلاند. وقعت جرائم القتل بين يوليو 1941 وأغسطس 1944 بالقرب من محطة القطار في بوناري (بانيرياي حاليًا)، إحدى ضواحي فيلنيوس الحالية في ليتوانيا. قُتل نحو 70,000 يهودي في بوناري، بالإضافة إلى 20,000 بولندي، و 8,000 أسير حرب روسي، معظمهم من فيلنا القريبة (فيلنيوس)، وغيتو فيلنا المنشئ حديثًا.
كانت ليتوانيا من أولى المواقع خارج بولندا المحتلة في الحرب العالمية الثانية التي يمارس فيها النازيون جرائم القتل الجماعي بحق اليهود كجزء من خطة الحل الأخير. من بين 70,000 يهودي يعيشون في فيلنا، نجا فقط 7,000 (أو 10 بالمئة) من الحرب وفقًا لسنايدر. اعتبارًا من يونيو 1941 بلغ عدد السكان حسب تقدير سيدليس 80,000 يهودي أو نصف سكان المدينة. ووفقًا لموسوعة الهولوكوست وغيرها، قُتل أكثر من ثلثيهم أو ما لا يقل عن 50,000 يهودي قبل نهاية عام 1941.