مجموعة خليلي للفن الياباني هي مجموعة خاصة من الفنون الزخرفية من اليابان في عصر ميجي (1868-1912) جمعها الباحث والمجمع والمحسن البريطاني ناصر د. خليلي. حيث تشمل أعمالها الفنية البالغ عددها 2200 عملًا معدنيًا ومينا وخزفًا وأشياء مطلية وفنًا نسيجيًا مما يجعلها قابلة للمقارنة فقط بمجموعة العائلة الإمبراطورية اليابانية من حيث الحجم والجودة. وكان عصر ميجي وقتًا استوعبت فيه اليابان بعض التأثيرات الثقافية الغربية واستخدمت الأحداث الدولية للترويج لفنها الذي أصبح مؤثرًا للغاية في أوروبا. فبدلاً من تغطية النطاق الكامل للفنون الزخرفية في عصر ميجي ركز خليلي على الأشياء ذات الجودة التقنية والفنية العالية. وقد صنع بعض الأعمال فنانون من البلاط الإمبراطوري للمعارض الكبرى في أواخر القرن التاسع عشر. أما المجموعة فهي واحدة من ثماني مجموعات جمعها ونشرها وعرضها خليلي.
مع أن المجموعة ليست معروضة للجمهور بوجه دائم إلا أن مقتنياتها مُعارة للمؤسسات الثقافية وظهرت في العديد من المعارض منذ عام 1994 فصاعدًا. وقد أُقيمت معارض مُقتطعة حصريًا من المجموعة في المتحف البريطاني ومتحف فان جوخ ومتحف بورتلاند ومتاحف الكرملين في موسكو ومؤسسات أخرى حول العالم.