مجتبى حسيني خامنئي (بالفارسية: مجتبی حسینی خامنهای؛ مواليد 8 سبتمبر 1969) هو سياسي إيراني ورجل دين شيعي يشغل منصب المرشد الأعلى الثالث لإيران منذ 8 مارس 2026. وهو الابن الثاني للمرشد الأعلى السابق علي خامنئي وأحد أفراد عائلته.
وُلد في مشهد من أصول أذرية ايرانية ، وكان في التاسعة من عمره حين برز والده شخصيةً محوريةً في الثورة الإسلامية في إيران. تلقّى تعليمه الأوّلي في سردشت ومهاباد، وأتمّ دراسته الثانوية في طهران، ثم درس العلوم الدينية تحت إشراف والده ومحمود هاشمي شاهرودي. انضم إلى الحرس الثوري الإيراني عام 1987 وشارك في الحرب العراقية الإيرانية. وفي عام 1999، واصل دراسته الحوزوية في قم ليصبح رجل دين، ثم انضمّ إلى حوزة قم العلمية مدرّساً للعلوم الدينية. وتولّى قيادة ميليشيا الباسيج شبه العسكرية التطوعية عام 2009.
وعقب اغتيال والده في حرب إيران 2026، انتخبه مجلس الخبراء الإيراني خلفاً له. ويُصنَّف في توجهه السياسي وفقهه الديني ضمن أشد التيارات تطرفاً في صفوف التيار الأصولي الإيراني. ويرى المحللون عموماً أنه أكثر ميلاً من والده نحو تطوير برنامج الأسلحة النووية الإيراني، إذ يدعو إلى إعادة تفسير فتوى خامنئي ضد الأسلحة النووية.
لم يُظهر خامنئي نفسه علنًا منذ إصابته في بداية الحرب، ما أثار شكوكًا حول وضعه الصحي، ويدور تكهن الخبراء حول احتمال إصابته بجروح بالغة، أو عدم قدرته على الظهور أمام الكاميرا، أو حتى موته.