متلازمة القناة المولرية المستديمة (بالإنجليزية: Persistent Müllerian duct syndrome (PMDS)) هي وجود مشتقات القناة المولرية (قناتي فالوب والرحم و/أو الجزء العلوي من المهبل) في ما يمكن اعتباره حيوانًا ذكرًا طبيعيًا وراثيًا وجسديًا من خلال الإنسان النموذجي. في البشر، عادة ما تكون متلازمة القناة المولرية المستديمة نتيجة لاضطراب خلقي متنحي ويعتبره البعض شكلاً من أشكال الخنوثة الكاذبة بسبب وجود مشتقات القناة المولرية.
تشمل السمات النموذجية الخصية غير النازلة (الخصية الخفية) ووجود رحم صغير متخلف عند الرضيع أو البالغ Xy. وتنجم هذه الحالة عادةً عن نقص تأثير الهرمون المضاد لمولر (anti-Müllerian hormone:AMH) الجنيني بسبب طفرات في جين AMH أو مستقبل الهرمون المضاد لمولر، ولكنها قد تكون أيضًا نتيجة لعدم حساسية العضو المستهدف تجاه الهرمون المضاد لمولر.
يمكن أن تظهر المتلازمة أيضًا في الحيوانات غير البشرية.