كرة القدم هي الرياضة الأكثر شعبية في سلوفينيا، ويشرف عليها اتحاد سلوفينيا لكرة القدم (السلوفينية: Nogometna zveza Slovenije). وتشارك سلوفينيا في كرة القدم الدولية بصفتها دولة مستقلة منذ عام 1991، عندما نالت البلاد استقلالها عن جمهورية يوغوسلافيا الاتحادية الاشتراكية. وقد تأهل منتخب سلوفينيا لكرة القدم لأربع بطولات كبرى (يورو 2000، وكأس العالم 2002، وكأس العالم 2010، ويورو 2024).
أكبر ثلاثة أندية في سلوفينيا هي ماريبور، ومورا، وأولمبيا.