قضية أطفال اليمن هي قضية ثارت في إسرائيل، تعود إلى مطلع الخمسينات من القرن العشرين، وارتبطت باختفاء أطفال يهود اليمن، ممن هاجروا إلى إسرائيل، فور وصول عائلاتهم ارض مطار بن غوريون، ضمن عملية عملية بساط الريح.
تستمر الاتهامات الواسعة الانتشار بإعطاء الرضع أو بيعهم للناجين الأشكناز من الهولوكوست ممن كانوا بدون أطفال في عملية منهجية سرية. وخلصت الإستنتاجات التي توصلت إليها ثلاث لجان رسمية منفصلة أقيمت للتحقيق في القضية بالإجماع إلى أن غالبية الأطفال دفنوا بعد موتهم بسبب الأمراض. استطاع اختبار الأبوة من الحمض النووي أن يؤكد، في بعض الحالات، أن الأطفال المتبنين الذين يحاولون تعقب آباءهم البيولوجيين ولدوا لعائلات يمنية أُبلغت بأن أطفالهم قد ماتوا. ووصف رئيس الوزراء الإسرائيلي بنيامين نتنياهو، القضية بأنها «جرح مفتوح لا يزال ينزف» للعديد من العائلات التي لا تعرف ما حدث للأطفال الذين اختفوا.