علم الوراثة المحافظة (الإنجليزية: Conservation genetics) هو العلم الذي يهدف إلى حفظ التنوع البولوجيي الذي يعني فهم تركيب الجينات في الكائنات الحية لتجنب انقراضها في المستقبل حيث يتم تطبيق طرق وراثية للحفاظ على الكائنات الحية عن طريق زيادة عدد الكائنات الحية المهددة الانقراض والحفاظ على التنوع البولوجيي.