علم الجينوم المعرفية هو مجال فرعي من علم الجينوم المتعلقة الوظيفة الإدراكية فيها الجينات وتسلسل غير الترميز من الحي الجينوم تتعلق بصحة ونشاط الدماغ ودراستها. من خلال تطبيق علم الجينوم المقارن، تتم مقارنة المجموع المورثي من أنواع متعددة من أجل تحديد الاختلافات الجينية والنمطية بين الأنواع. تشمل الخصائص المظهرية المرصودة المتعلقة بالوظيفة العصبية السلوك والشخصية وعلم التشريح العصبي وعلم الأمراض العصبية. تستند النظرية وراء علم الجينوم المعرفي إلى عناصر علم الوراثة، وعلم الأحياء التطوري، وعلم الأحياء الجزيئي، وعلم النفس المعرفي، وعلم النفس السلوكي، وعلم وظائف الأعضاء العصبية.
الذكاء هو السمة السلوكية التي تمت دراستها على نطاق واسع. في البشر، يتم التعبير عن ما يقرب من 70٪ من جميع الجينات في الدماغ. يمثل التباين الجيني 40٪ من التباين الظاهري. تم استخدام المناهج في الجينوميات المعرفية للتحقيق في الأسباب الجينية للعديد من الاضطرابات النفسية والعصبية بما في ذلك متلازمة داون والاضطراب الاكتئابي الرئيسي والتوحد ومرض الزهايمر .