خط سكة حديد بابانوسا-واو هو خط سكة حديد دولي يربط مدينة بابانوسا في السودان بمدينة واو، ثاني أكبر مدن جنوب السودان، وينتهي عند محطة سكة حديد واو.
ويبلغ طول الخط نحو 445.5 كيلومتراً، ويعمل بمقياس سكك حديدية يبلغ 1,067 ملم (3 أقدام و6 بوصات). ويمتد نحو 195.5 كيلومتراً داخل السودان، بينما يقع نحو 250 كيلومتراً منه داخل جنوب السودان.
ويُعد الجزء الواقع داخل جنوب السودان خط السكة الحديدية الوحيد في جنوب السودان.
الخط الحديدي يعمل، لكن حركة المرور عليه تعتمد على عدة عوامل، منها العلاقات السياسية والاقتصادية بين السودان وجنوب السودان، ووجود قوات متمردة بالقرب من الخط في كلا البلدين، والوضع السياسي الإقليمي خلال الحرب الأهلية في جنوب السودان. كان من المتوقع أن يبدأ الخط بنقل قطارات الشحن عام 2018، إلا أن ذلك لم يتحقق حتى عام 2022.