جزر باكان هي مجموعة جزر في جزر الملوك بإندونيسيا وتمسى باسم أكبر جزيرة فيها وهي جزيرة باكان. تتميز الجزر المناطق الجبلية والغابات. وتقع الجزر في جنوب جزيرة تيرنات وغرب الجزء الجنوبي من جزيرة هالماهيرا. جزيرة باكان هي أكبر الجزر، أما ثاني وثالث الجزر من حيث المساحة فهما كاسيروتا ومانديولي. هناك العشرات من الجزر الصغيرة الأخرى في المجموعة.
الجزر جزء من مقاطعة مالوكو الشمالية، يبلغ عدد سكان الجزر حوالي 56000 شخص منهم حوالي 8000 يعيشون في المركز (لابوها).