توطين العلوم (بالإنجليزية: Localization of Sciences أو Indigenization of Knowledge) هو مقاربة إبستيمولوجية وسياسة تنموية وتعليمية تعنى بتكييف وتعديل البنيات النظرية، والمفاهيمية، والمناهج الإجرائية للعلوم (سواء الإنسانية والاجتماعية أو الطبيعية والتكنولوجية) لتصبح قادرة على التفاعل العلمي والعضوي مع المعطيات الثقافية والاجتماعية والبيئية المحلية للمجتمعات، بدلاً من الاعتماد الصرف على النقل والاستهلاك السطحي للنظريات المستوردة.
لا يعني التوطين الانغلاق عن المنجز العلمي العالمي أو رفض الكونية العلمية، بل يهدف إلى كسر "الاستعمار المعرفي" والتبعية الفكرية للنماذج الجاهزة، من خلال خلق بيئة بحثية وأكاديمية قادرة على الإنتاج الذاتي للمعرفة وتوليد حلول ومفاهيم تناسب الواقع المحلي.