في علم الوراثة الطبية، تغاير الزيجوت المركب هو حالة وجود اثنين أو أكثر من الأليلات المتنحية غير المتجانسة في موضع معين يمكن أن يسبب مرضًا وراثيًا في حالة متغاير الزيجوت. أي أن الكائن الحي هو مركب متغاير الزيجوت عندما يحتوي على أليلين متنحيين لنفس الجين، ولكن مع اختلاف هذين الأليلين عن بعضهما البعض (على سبيل المثال، قد يتحور كلا الأليلين ولكن في موقعين مختلفين). يعكس تغاير الزيجوت المركب تنوع قاعدة الطفرة للعديد من الاضطرابات الوراثية الجسدية المتنحية. نشأت طفرات في معظم الجينات المسببة للأمراض عدة مرات. هذا يعني أن العديد من حالات المرض تنشأ لدى الأفراد الذين لديهم أليلين غير مرتبطين، وهما من الناحية الفنية متغاير الزيجوت، لكن كلا الأليلين معيبان.
غالبًا ما تكون هذه الاضطرابات معروفة في شكل كلاسيكي، مثل الحالة المتنحية متماثلة الزيجوت لطفرة معينة منتشرة على نطاق واسع في بعض السكان. في أشكاله المركبة غير المتجانسة، قد يكون للمرض اختراق أقل، لأن الطفرات المعنية غالبًا ما تكون أقل ضررًا في تركيبة من الفرد متماثل الزيجوت مع الأعراض الكلاسيكية للمرض. نتيجة لذلك، غالبًا ما تصيب متغاير الزيجوت المركب بالمرض في وقت لاحق من الحياة، مع أعراض أقل حدة. على الرغم من أن تغاير الزيجوت المركب كسبب للأمراض الوراثية قد اشتبه به قبل ذلك بكثير، إلا أن التأكيد الواسع النطاق لهذه الظاهرة لم يكن ممكنًا حتى ثمانينات القرن العشرين، عندما جعلت تقنيات تفاعل البوليمراز المتسلسل لتضخيم الحمض النووي من الفعالية من حيث التكلفة لتسلسل الجينات وتحديد الأليلات متعددة الأشكال.