نظرة عامة شاملة حول تشيب-إكسو

سير عمل رقاقة- EXO:

إن تشيب-اكسو هي طريقة تعتمد على الهيموغلوبين المناعي للكروماتين لرسم خرائط المواقع التي يرتبط فيها بروتين مهم (عامل النسخ) بالجينوم.

إنه تعديل لبروتوكول ChIP-seq ، مما يحسن دقة مواقع الربط من مئات أزواج القواعد إلى زوج أساسي واحد تقريبًا.

وهي تستخدم استخدام نوكليازات خارجية لتحلل خيوط الحمض النووي المرتبط بالبروتين في اتجاه 5'-3 'إلى عدد صغير من النيوكليوتيدات في موقع ربط البروتين.

يتم تحديد النيوكليوتيدات من النهايات المعالجة بالخلايا الخارجية باستخدام مزيج من تسلسل الحمض النووي والمصفوفات الدقيقة و PCR. ثم يتم تعيين هذه التسلسلات للجينوم لتحديد المواقع على الجينوم الذي يرتبط فيه البروتين.