تشارلز ألين توماس (بالإنجليزية: Charles Allen Thomas) هو كيميائي ورائد أعمال ومهندس أمريكي، ولد في 15 فبراير 1900 في مقاطعة سكوت في الولايات المتحدة، وتوفي في 29 مارس 1982 في ألباني في الولايات المتحدة.
بين عامي 1943 و1945، أشرف على جهود مشروع مانهاتن في تنقية وإنتاج البلوتونيوم. كما أشرف على تطوير الأساليب الصناعية لتكرير البولونيوم، الذي استُخدم مع البريليوم في محفزات الأسلحة الذرية كجزء من قسم دايتون للمشروع، والذي أُجري جزئيًا على ملكية عائلة زوجته. وقرب نهاية الحرب، تولى إدارة مختبرات كلينتون في أوك ريدج بولاية تينيسي. وعلى الرغم من انسحاب شركة مونسانتو من أوك ريدج في ديسمبر 1947، فقد تولت الشركة لاحقًا مسؤولية مختبرات ماوند في عام 1948. وفي عام 1946، عيّنه وزير الخارجية دين أتشيسون في لجنة لتقييم التفتيش الذري الدولي، والتي أصدرت تقرير أتشيسون-ليلينثال. وعمل لاحقًا مستشارًا لمجلس الأمن القومي في عام 1953 ومثل الولايات المتحدة في لجنة الطاقة الذرية التابعة للأمم المتحدة.