تُعرّف بنية الجين أو بنية المورثة بأنها تنظيم العناصر المتسلسلة الخاصة ضمن الجين. تحمل الجينات المعلومات الضروريةً للخلايا الحية لتستمر وتتكاثر، وتتكون في أغلب الكائنات الحية من الحمض النووي الريبوزي منقوص الأكسجين (الدنا)، إذ يحدد التسلسل الخاص للدنا وظيفة الجين. يُنسخ الجين من شريط الدنا إلى الحمض النووي الريبوزي (الرنا) الذي قد يكون غير مُشفِّر (رنا غير مشفر) يملك وظيفةً مباشرةً، أو يكون رسولًا وسيطًا (رنا رسول) يُترجم لاحقًا إلى بروتين. تُضبط كل خطوة مما سبق بعناصر أو مناطق محددة من التسلسل الجيني، وبالتالي يحتاج كل جين إلى عناصر متسلسلة متعددة ليصبح وظيفيًا، وهذا يشمل التسلسل المشفر للبروتين الوظيفي أو الرنا غير المشفر أو مناطق التسلسل المنظم المتعددة. قد تكون هذه المناطق قصيرةً لا تتعدى القليل من الأزواج القاعدية، أو تمتد على طول الآلاف منها.
تتشابه بدائيات النوى وحقيقيات النوى في الكثير من الخصائص البنيوية الجينية، وتعود هذه العناصر المشتركة بينها أساسًا إلى السلف المشترك للحياة الخلوية في العضويات منذ ما يزيد على ملياري سنة. تعكس الاختلافات الرئيسة بين بدائيات وحقيقيات النوى في البنية الجينية عملية النسخ وآلية الترجمة الجينية المتشعبة. يُعد فهم البينة الجينية أساسيًا لفهم عملية تذييل الجين والتعبير عنه ووظيفته ضمن الخلية.