بروتوكول ناغويا أو بروتوكول ناغويا بشأن الحصول على الموارد الجينية والتقاسم العادل والمنصف للمنافع الناشئة عن استخدامها الملحق باتفاقية التنوع البيولوجي أو بروتوكول ناغويا بشأن الحصول وتقاسم المنافع هو اتفاق تكميلي لعام 2010 لاتفاقية عام 1992 بشأن التنوع البيولوجي. هدفها هو تنفيذ أحد الأهداف الثلاثة لاتفاقية التنوع البيولوجي: التقاسم العادل والمنصف للمنافع الناشئة عن استخدام الموارد الجينية، وبالتالي المساهمة في حفظ التنوع البيولوجي واستخدامه المستدام. وتحدد التزامات الأطراف المتعاقدة لاتخاذ تدابير تتعلق بالحصول على الموارد الجينية وتقاسم المنافع والامتثال.
تم اعتماد البروتوكول في 29 أكتوبر 2010 في ناغويا اليابان ودخل حيز التنفيذ في 12 أكتوبر 2014. اعتبارًا من أكتوبر 2020 تم التصديق عليه من قبل 128 طرفًا، بما في ذلك 127 دولة عضو في الأمم المتحدة والاتحاد الأوروبي. وقد تم الإعراب عن مخاوف من أن البيروقراطية والتشريعات المضافة يمكن أن تضر برصد وجمع التنوع البيولوجي، والحفظ ، والاستجابة الدولية للأمراض المعدية، والبحوث.