البروتوبرفيرين 9 هو مركب عضوي من أكثر البورفيرنيات شيوعا في الطبيعة، له لون غامق ولا ينحل بالماء. يوجد البروتوبرفيرين الحر في الطبيعة بشكل معقدات مع الحديد، وعندما يشكل معقدا مع الحديدوز يدعى هيم؛ والهيمات مجموعات ضَميمَة هامة في بعض البروتينات منها هيموغلوبين ومَيوغلوبين وسيتوكروم سي. ويمكن أيضا أن تشكل معقدات مع معادن أخرى مثل الزنك.
البروتوبرفيرين 9 هو جزيء ضخم مستوٍ، فيه مجموعات N-H في وَضع مَفْروق.