بدأ برنامج الأسلحة البيولوجية في الولايات المتحدة الأمريكية في عام 1943، وأُنهي في عام 1969. بدأ البرنامج رسميًا في ربيع عام 1943 بناءً على أوامر من الرئيس الأمريكي فرانكلين روزفلت، واستمر إجراء الأبحاث بعد انتهاء الحرب العالمية الثانية، فجمعت الولايات المتحدة مخزونًا كبيرًا من العوامل الحيوية والأسلحة. ساهم البرنامج، على مرّ تاريخه المؤلف من 27 سنة، في تسليح وتخزين العوامل الحيوية السبع التالية (وأجرى أبحاثًا مبدئية على العديد من العوامل الأخرى):
العصوية الجمرية
الفرنسيسيلة التولارية
البروسيلا
كوكسيلة بورنيتية
فيروس التهاب دماغ الحصان الفنزويلي
ذيفان السجقية
ذيفان معوي نوع ب
كان برنامج الأسلحة البيولوجية الأمريكي سريًا طوال فترة وجوده، وكُشف لاحقًا عن انتشار الاختبارات الميدانية والمخبرية (يشمل بعض الاختبارات الميدانية استخدام العوامل المحاكية على أفرادٍ من دون الحصول على موافقتهم). تجسدت السياسة الرسمية للولايات المتحدة في ردع استخدام الأسلحة البيولوجية ضد قوات الولايات المتحدة أولًا، ثم تنفيذ رد انتقامي إذا فشل الردع.
أنهى الرئيس الأمريكي ريتشارد نيكسون، ظاهريًا، كافة الجوانب الهجومية لبرنامج الأسلحة البيولوجية الأمريكي في عام 1969. أقرّت الولايات المتحدة بروتوكول جنيف عام 1925 ومعاهدة حظر الأسلحة البيولوجية عام 1972 -وهما معاهدتان دوليّتان يُحظر بموجبِهما استخدام أسلحة الحرب البيولوجية. مع ذلك، أثارت برامج الدفاع البيولوجي الأمريكية مؤخرًا الشكوك حيال سعي الولايات المتحدة إلى إجراء أبحاث تحظرها الأمم المتحدة.