انقلاب 1961 في سوريا (انقلاب الانفصال)، هو انتفاضة لمجموعة من ضبَّاط الجيش السوري جرت في 28 سبتمبر 1961، وهو سادس انقلاب عسكري في تاريخ سوريا الحديث، أدَّى إلى تفكك الجمهورية العربية المتحدة، وإعادة تأسيس الجمهورية السورية المستقلَّة.
كانت السُّلطة بأكملها في يد الجيش حينئذ، إلا أنه اختار عدم تسيير أمور البلاد مباشرة، وبدلًا من ذلك أوكلَ للسياسيين من الأحزاب التقليدية في عهد الجمهورية السورية مهمَّة تشكيل الحكومة الانفصالية. كانت الدولة التي استُعيدَت تُعَدُّ استمرارًا للجمهورية السورية، ولكن بسبب تأثير الناصريين والقوميين العرب جرى اعتمادُ اسم جديد وأصبحت الجمهورية العربية السورية. كان النظام المُستعاد هشًّا وفوضويًّا، وأثَّرت صراعات الجيش الداخلية في سياسة الحكومة. وكان السياسيون المحافظون التقليديون على اتصال زائد بالجيش، الذي تمكَّن في نهاية المطاف من إبعاد النظام القديم بانقلاب 8 مارس (آذار) 1963 بقيادة حزب البعث.