انتهاكات حقوق الإنسان في إقليم بلوشستان تشير إلى انتهاكات حقوق الإنسان التي تحدث في ظل التمرد المستمر في بلوشستان. وقد أثار هذا الوضع قلق المجتمع الدولي. ويُعزى وضع حقوق الإنسان في بلوشستان إلى الصراع الطويل الأمد بين القوميين البلوش (وكذلك الجماعات الإرهابية البلوشية مثل جيش تحرير بلوشستان) وقوات الأمن الباكستانية.
قال براد آدامز، مدير فرع آسيا لمنظمة هيومن رايتس ووتش، إن الحكومة الباكستانية لم تبذل ما يكفي من الجهد لوقف انتهاكات حقوق الإنسان المنتشرة في المنطقة، والتي تشمل التعذيب والاختفاء القسري للمشتبه في تورطهم في الإرهاب أو معارضة الجيش الباكستاني، وسوء معاملة المقاتلين أو المجرمين الأسرى، والقتل خارج نطاق القضاء. كما ارتكب المسلحون الانفصاليون انتهاكات واسعة النطاق. ووفقًا لمنظمة هيومن رايتس ووتش، فإن المسلحين الانفصاليين البلوش مسؤولين عن العديد من الهجمات على المدارس والمعلمين والطلاب في المقاطعة بهدف التطهير العرقي للمقاطعة.
اعتبارًا من عام 2018، وفقًا لصحيفة نيويورك تايمز، كانت الدولة العميقة الباكستانية تستخدم المسلحين الإسلاميين لمهاجمة الانفصاليين البلوش. تواصل جواسيس من جهاز الاستخبارات الباكستاني مع الأكاديميين والصحفيين في الولايات المتحدة، وحذروهم من التحدث عن التمرد في بلوشستان أو انتهاكات حقوق الإنسان التي يرتكبها الجيش الباكستاني، كما هددوا بإيذائهم أو إيذاء عائلاتهم إذا استمروا في التحقيق في الصراع.