أُجريت الانتخابات الرئاسية في جزر القمر في 6 مارس 1996، مع جولة ثانية في 16 مارس. وجاءت النتيجة بفوز محمد تقي عبد الكريم، الذي كان قد جاء في المرتبة الثانية في انتخابات عام 1990 (على الرغم من فوزه بأعلى الأصوات في الجولة الأولى)، وكان قد تولّى مهام الرئيس بالإنابة لفترة وجيزة في أكتوبر 1995 في أعقاب محاولة انقلابية أخرى قادها بوب دينار.