باعتبارها منطقة حضرية تضم نحو 42 مليون نسمة، تمتلك جاكرتا مجموعة متنوعة من أنظمة النقل. وقد حازت جاكرتا جائزة النقل المستدام العالمية لعام 2021 لنظام النقل العام المتكامل فيها.
ومع ذلك، لا يزال نظام النقل العام في جاكرتا متخلفًا بشكل كبير مقارنة بحجم المدينة.
ركزت المدينة على تطوير شبكات الطرق، التي صُممت في الغالب لاستيعاب المركبات الخاصة. ومن السمات البارزة لشبكة الطرق الحالية وجود شبكة الطرق المدفوعة، المكوّنة من الطريق الدائري الداخلي والطريق الدائري الخارجي، إضافةً إلى خمسة طرق سريعة تمتد نحو الخارج. توفر هذه الشبكة وصلات داخلية وخارجية للمدينة. كما اعتمدت سياسة الفردي والزوجي التي تقيّد استخدام الطرق بالمركبات ذات اللوحات الفردية أو الزوجية في أيام محددة، وذلك في إجراء انتقالي للتخفيف من الازدحام المروري إلى حين تطبيق نظام التسعير الإلكتروني للطريق.
توجد العديد من محطات الحافلات في المدينة، حيث تعمل الحافلات على خطوط مختلفة تربط الأحياء داخل حدود المدينة، إضافة إلى مناطق جاكرتا الكبرى ومدن أخرى في جزيرة جاوة.
وتُعد محطة محطة حافلات بولو غيبانغ الأكبر من نوعها في جنوب شرق آسيا.
أما المحطتان الرئيستان لقطارات المسافات الطويلة فهما غامبير وسوق سينين. ويربط قطار "ووش" فائق السرعة جاكرتا بمدينة باندونغ، كما يُخطط لخط آخر يربط جاكرتا بـسورابايا.
اعتبارًا من سبتمبر 2023، بلغت تغطية خدمات النقل العام في جاكرتا 86%، ويُستهدف رفعها إلى 95%. وتتكون منظومة النقل السريع في جاكرتا الكبرى من:
حافلات ترانزجاكرتا BRT، قطار جاكرتا الخفيف، مترو جاكرتا، قطار الضواحي KRL، قطار جابوديبيك الخفيف، وخط قطار مطار سوكارنو-هاتا.
كما تبني الإدارة المحلية مناطق تنمية موجهة نحو النقل مثل محطة تبادل [[|Dukuh Atas TOD|Dukuh Atas]] وSW-ASEAN لتسهيل انتقال الركاب بين وسائل النقل المختلفة.
توفر أنظمة الحافلات الخاصة مثل كوباجا، ومترو ميني، ومايساري باكتي، ومواصلات الركاب في جاكرتا خدمات هامة للركاب عبر مسارات عديدة، وقد استُبدل العديد منها بحافلات مينيترانس وميتروترانس أو بحافلات ميكرو ميكروترانس. تُحظر عربة السحب في المدينة بسبب تسببها في الازدحام المروري، بينما توفر عربات الباجاج خدمة النقل في الأزقة الخلفية. كما تلعب حافلات الأنكوت الصغيرة دورًا مهمًا في نقل الركاب.
وتتوفر كذلك سيارات الأجرة والأوجيك (دراجات نارية).
بحسب بيانات يناير 2023، يستخدم نحو 2.6 مليون شخص وسائل النقل العام يوميًا في جاكرتا.
شرعت المدينة في مشروع لإنشاء نحو 500 كيلومتر من مسارات الدراجات. وبحلول يونيو 2021، كانت جاكرتا قد أنجزت 63 كيلومترًا من المسارات، مع التخطيط لإضافة 101 كيلومتر أخرى قبل نهاية العام.
يُعد مطار سوكارنو–هاتا الدولي (CGK) المطار الرئيسي الذي يخدم منطقة جاكرتا الكبرى، بينما يستقبل مطار حليم برداناكوسوما (HLP) رحلات داخلية وبعض الرحلات الخاصة. وتشمل المطارات الأخرى في منطقة جاكرتا الحضرية كلًا من مطار بوندوك كابي ومهبطًا في جزيرة بولاو بانجانغ ضمن أرخبيل جزر الألف.
يُعد ميناء تانجونغ بريوك، وهو أكثر الموانئ ازدحامًا في إندونيسيا، الميناء البحري الرئيس لجاكرتا، ويخدم العديد من خطوط العبارات. أما الميناء القديم سوندا كلاپا فيستقبل سفن بينيسي التقليدية ذات الصاريين لنقل البضائع بين الجزر. ويُستعمل مورا أنغي ميناءً عامًا يربط بجزر الألف، بينما يُستخدم مرسى أنكول منفذًا سياحيًا.
أما عن وسائل الدفع في النقل العام (لـKRL Commuterline، وTransjakarta، وLRT Jakarta، وLRT Jabodebek، وMRT Jakarta، وخط قطار مطار سوكارنو–هاتا) فقد أصبحت كلها دون نقد عبر نظام جاك لينكو.
ويمكن للمسافرين استخدام بطاقة جاك لينكو أو بطاقات الدفع الإلكتروني الصادرة عن المصارف، وهي:
BRIZZI (من بنك راكيات اندونيسيا)
TapCash (من بنك نيجارا اندونيسيا)
e-Money (من بنك منديري)
Flazz (من بنك آسيا المركزي)
JakCard (من بنك DKI)
وتُقبل هذه البطاقات في خطوط القطارات والحافلات، وعند دفع رسوم الطرق السريعة ومواقف السيارات. وتتوافر البطاقات في فروع البنوك أو عبر التجارة الإلكترونية.
ويمكن شحنها عبر:
متاجر إندومارت
متاجر ألفامارت
متاجر ألفاميدي
متاجر برتامينا
آلات بيع بطاقات e-Money
أجهزة الصراف الآلي والخدمات المصرفية عبر الجوال بتقنية NFC
تقع جاكرتا ضمن طريق الحرير البحري الذي يمتد من السواحل الصينية عبر قناة السويس إلى البحر المتوسط ثم إلى منطقة البحر الأدريني الأعلى.