يتبع الفساد في جزر القمر الأنماط الشائعة للفساد الحكومي، حيث يستغل المسؤولون الحكوميون سلطاتهم لتحقيق مكاسب شخصية، مما يؤثر سلبًا على المصلحة العامة في البلاد.
في مؤشر الفساد لعام 2023 الذي أصدرته منظمة الشفافية الدولية، حصلت جزر القمر على 20 نقطة على مقياس يتراوح بين 0 (يعني فسادًا مرتفعًا جدًا) إلى 100 (يعني نظافة عالية جدًا) مما يعني أنها من أكثر الدول فسادًا. عند ترتيبها حسب النقاط، احتلت جزر القمر المرتبة 162 من أصل 180 دولة في المؤشر. حيث تُعتبر الدولة الأولى في الترتيب الأكثر نزاهة في القطاع العام. للمقارنة على مستوى العالم، أعلى درجة في العالم كانت 90 (لأكثر الدول نزاهة) مما يعني أن الدولة التي حصلت عليها تُعتبر الأكثر نزاهة. بينما كان المتوسط 43، وأقل درجة هي 11 (لأسوأ الدول)والتي تُشير إلى أن الدولة التي حصلت عليها تُعتبر الأكثر فسادًا. وعند النظر إلى النتائج الإقليمية لبلدان أفريقيا جنوب الصحراء، كان متوسط الفساد هناك 33 نقطة، مع أعلى درجة تبلغ 71 وأدنى درجة 11.