يظل الفساد في اليابان مصدر قلق كبير للبلاد. شهدت اليابانالعديد من قضايا الفساد طوال تاريخها. تم تصنيف حالات الفساد إلى ثلاثة أنواع: فساد التفاحة الفاسدة، فساد الإجراءات التشغيلية القياسية، والفساد النظامي. تشمل الممارسات الفاسدة الرشوة، التبرعات السياسية، وتلك المتعلقة بالأماغوداري، من بين أمور أخرى. كما كانت هناك حوادث بارزة من سوء السلوك المؤسسي.
على مر السنين، اتخذت الحكومة اليابانية خطوات لمعالجة الفساد من خلال الإصلاحات والقوانين. وقد احتلت اليابان المركز السادس عشر في مؤشر مدركات الفساد لعام 2023 الذي أصدرته منظمة الشفافية الدولية، برصيد 73، وهو التصنيف الذي حافظت عليه منذ عام 2021. يقيم مؤشر تصورات الفساد القطاع العام في 180 دولة على مقياس من 0 ("فاسد للغاية") إلى 100 ("نظيف جدًا"). الدولة التي تحقق أعلى درجة تحتل المركز الأول.