وفيما يلي قائمة جزئية للضحايا المدنيين في الانتفاضة الثانية.
وفقًا للمعهد الدولي لمكافحة الإرهاب، فإن 887 (78%) من بين 1137 إسرائيليًا قُتلوا في هجمات بين سبتمبر/أيلول 2000 و2005 كانوا من المدنيين. وأصيب 8341 إسرائيليًا آخرين خلال هذه الفترة، بما في ذلك 5676 مدنيًا و2665 من أفراد قوات الأمن. كانت أغلب الإصابات ناجمة عن تفجيرات انتحارية، على الرغم من أن الإسرائيليين قُتلوا أيضًا بواسطة قنابل مزروعة، وإطلاق النار، والرجم، والطعن، والشنق، والصواريخ، وغيرها من أساليب الهجوم.
وبحسب منظمة بتسيلم، فإنه من بين 6371 فلسطينياً قتلتهم القوات الإسرائيلية خلال السنوات العشر من عام 2000 إلى عام 2010، كان هناك على الأقل 2996 شخصاً لم يشاركوا في الأعمال العدائية عندما قتلوا، وكان 1317 منهم قاصرين. من بين 1083 إسرائيليًا قُتلوا، كان 741 مدنيًا (124 قاصرًا).