في أعقاب الاستقلال عن الاتحاد السوفيتي، أدى الكساد الاقتصادي الكبير إلى خفض «التمويل العام» للتعليم في كازاخستان، من 6% من الناتج المحلي الإجمالي في عام 1991 إلى نحو 3% في عام 1994، قبل أن يرتفع إلى 4% في عام 1999. ما يزال المعلمون في المدارس الابتدائية والثانوية يتقاضون أجورًا متدنية للغاية، ففي عام 1993 ترك أكثر من ثلاثين ألف معلم (أو نحو سُبع هيئة التدريس في عام 1990) التعليم، وسعى العديد منهم للبحث عن وظائف أكثر ربحية.
نص دستور كازاخستان لعام 1995 على التعليم الثانوي الإلزامي الاجتماعي. تنافس المواطنون على مؤسسات التعليم العالي الاجتماعية. تزايد التعليم الخاص في البلاد، والتحق نحو 5% من الطلاب بالمدارس الخاصة التي ما تزال خاضعة لسيطرة الدولة التعسفية.
في عام 2000، انضمت حكومة كازاخستان إلى حكومتي جمهورية قيرغيزستان وطاجيكستان وآغا خان لإنشاء أول مؤسسة للتعليم العالي معتمدة دوليًا في العالم، وهي جامعة آسيا الوسطى. ضمت جامعة آسيا الوسطى ثلاث جامعات متساوية الحجم والمكانة في كل من الدول المؤسسة. الحرم الجامعي الكازاخستاني قيد الإنشاء في تيكيلي في منطقة جيتيسو، على بعد 35 دقيقة شرق العاصمة الإقليمية تالديكورغان، وثلاث ساعات بالسيارة من ألماتي. تستفيد جامعة آسيا الوسطى من موارد شبكة آغا خان للتنمية لتقديم معيار معترف به دوليًا للتعليم العالي في آسيا الوسطى. حاليًا، تدير الجامعة مدرسة للتعليم المهني والمستمر، مع مدرسة للدراسات الجامعية ومدرسة للدراسات العليا للتنمية قيد الإنشاء.
في عام 2002 قدم بنك التنمية الآسيوي المساعدة الفنية لكازاخستان لتحديد القضايا والأولويات الرئيسية في قطاع التعليم والمساهمة في تعزيز استراتيجية الحكومة لتنمية قطاع التعليم. قدمت الولايات المتحدة 137 عضوًا من فيلق السلام «للعمل في مجال التعليم وتنمية المنظمات غير الحكومية» في عام 2004.
بلغ معدل الإلمام بالقراءة والكتابة في كازاخستان 99.1% لدى الذكور، و97.7% لدى الإناث اعتبارًا من عام 1999.
عندما زارت وزيرة الخارجية الأمريكية كونداليزا رايس كازاخستان في الفترة ما بين 12 و13 أكتوبر 2006، قالت: «إن مستقبل أي دولة يعتمد على مستوى التعليم فيها. هذه هي زيارتي الرابعة لكازاخستان، وقد زرت بالفعل أتيراو وألماتي وتمكنت من رؤية المستوى العالي للتعليم في أمتكم، وهو مفتاح النجاح لأي بلد».
وجدت مبادرة قياس حقوق الإنسان أن كازاخستان لا تحقق سوى 81.0% مما ينبغي لها تحقيقه فيما يتعلق بالحق في التعليم استنادًا إلى مستوى دخل البلاد. تقسم مبادرة قياس حقوق الإنسان الحق في التعليم من خلال النظر إلى الحق في التعليم الابتدائي والثانوي. مع الأخذ في الاعتبار مستوى دخل كازاخستان، فإن الأمة تحقق فقط 62.2% مما ينبغي أن يكون ممكنًا بناءً على مواردها (الدخل) للتعليم الابتدائي و99.8% للتعليم الثانوي.