منذ منتصف العقد الأول من القرن الحادي والعشرين، قدّمت الولايات المتحدة دعمًا عسكريًا إلى قوات الدفاع الوطني الإثيوبية، وقوات الاتحاد الأفريقي، والحكومة الاتحادية الانتقالية الصومالية، ثم خليفتها الحكومة الفيدرالية الصومالية، في صراعاتها مع الفاعلين الإسلاميين في الصومال.
ترجع مشاركة الولايات المتحدة العسكرية في الصومال إلى تسعينيات القرن العشرين من خلال عمليتي قوة المهام الموحدة وعملية الأمم المتحدة الثانية في الصومال. شهد مطلع العقد الأول من القرن الحادي والعشرين تجدد التدخل العسكري الأمريكي في إطار الحرب على الإرهاب، حيث نُفذت عمليات جوية، ومهام للقوات الخاصة، وأنشطة استخباراتية، وبرامج تدريبية في عهود جورج بوش الابن، وباراك أوباما، ودونالد ترامب، وجو بايدن.
برز اتحاد المحاكم الإسلامية في مطلع العقد الأول من القرن الحادي والعشرين قوةً سياسيةً وعسكريةً كبرى، وأصبح بحلول منتصف عام 2006 الحكومة بحكم الأمر الواقع في معظم مناطق جنوب الصومال بعد هزيمته تحالفًا من أمراء الحرب مدعومًا من وكالة المخابرات المركزية. دعمت الولايات المتحدة الغزو الإثيوبي للصومال بهدف إطاحة حكم اتحاد المحاكم الإسلامية وتنصيب الحكومة الاتحادية الانتقالية الصومالية، مع نشر دعم جوي وقوات خاصة ووسائل استخباراتية أمريكية سرًا خلال التقدم نحو مقديشو عام 2006.
أدى إسقاط حكومة اتحاد المحاكم الإسلامية إلى اندلاع تمرد إسلامي عام 2007، وانتهى الاحتلال العسكري الإثيوبي مطلع عام 2009، وخلال هذه المرحلة تطورت حركة الشباب إلى فاعل تمرد قوي في الصراع الصومالي.
أسفر الدعم الأمريكي للغزو الإثيوبي عن تصاعد مشاعر معاداة أمريكا وزيادة العداء الشعبي تجاه كلٍ من الولايات المتحدة وإثيوبيا، مع تعزيز نفوذ التيارات الإسلامية الأكثر تشددًا، ووصفت المؤسسة العسكرية الأمريكية نفسها إدارة الحرب بأنها كانت ضعيفة التنفيذ.
واصلت القوات الأمريكية انخراطها في عمليات مكافحة التمرد ضد حركة الشباب خلال المرحلة اللاحقة من الحرب الأهلية الصومالية، معتمدة على الضربات الجوية والدعم الاستخباراتي والتدريب للقوات المحلية.
أعلن الرئيس دونالد ترامب في ديسمبر 2020 سحب معظم القوات الأمريكية من الصومال، قبل أن يقرر الرئيس جو بايدن في مايو 2022 إعادة نشر قوات أمريكية في البلاد بناءً على طلب الحكومة الصومالية.
تساند وحدات من الجيش الأمريكي المتمركزة في بونتلاند، وتحديدًا في إقليم بري، العمليات الجارية ضد تنظيم تنظيم الدولة الإسلامية في الصومال، وشهد عام 2025 تصعيدًا ملحوظًا في عدد الضربات الجوية الأمريكية.
خلصت منظمة العفو الدولية إلى أن العدد الفعلي للضربات الجوية الأمريكية في الصومال تجاوز الأرقام المعلنة رسميًا، وأشارت إلى أن القيادة العسكرية الأمريكية في أفريقيا صنّفت مرارًا مدنيين صوماليين قُتلوا في تلك الضربات على أنهم «إرهابيون».