أُجريت انتخابات رئاسية في أنجوان يومي 15 و29 حزيران 2008 عقب غزو أنجوان عام 2008 للإطاحة بمحمد بكر من منصب رئيس أنجوان. وفاز في الانتخابات موسى تويبوا الذي هزم محمد جعفرى في الجولة الثانية.
كان حوالي 128000 شخص مؤهلين للتصويت، وكان هناك 240 مركز اقتراع. تأهل خمسة مرشحين لخوض الانتخابات: بكر عبده (نائب موتسامودو)، باستوان سليمان (قاضٍ ورئيس سابق لمحكمة استئناف أنجوان)، محمد دجانفري (نائب رئيس سابق لجمعية اتحاد جزر القمر)، موسى طويبو (وزير سابق في حكومة سعيد محمد جوهر) وسوندي عبد اللطيف (محارب عسكري فرنسي مخضرم). وافقت المحكمة الدستورية على هؤلاء المرشحين في 20 آيار.
تأخر التصويت في الجولة الأولى في 15 حزيران، على الرغم من أنه كان من المقرر أن يبدأ في الساعة 7 صباحًا، لمدة ساعة في المدن الرئيسية، موتسامودو ودوموني، بسبب تأخر وصول أوراق الاقتراع أو المسؤولين الانتخابيين. وُضع نسبة المشاركة في الجولة الأولى عند 42.79٪.
كان تويبو يُعتبر وافدًا جديدًا على الساحة السياسية. صرّح بأنه يعرف "آليات انتشال أنجوان من التخلف"، وأيد السماح لبعض من خدموا في عهد محمد بكر بالبقاء في مناصبهم الإدارية نظرًا لخبرتهم وضرورة المصالحة. كما حظي بدعم رئيس جزر القمر أحمد عبد الله سامبي، بينما كان دجانفاري معروفًا لدى السكان المحليين نظرًا لعمله السياسي السابق.
بدأت حملة الجولة الثانية في 21 حزيران. فاز تويبو في جولة الإعادة بنسبة 52.37% مقابل 47.63% لجانفاري، بنسبة إقبال بلغت 48.98%؛ وكان لا بد من التحقق من صحة النتائج من قبل المحكمة الدستورية في غضون ثلاثة أيام. طعن جانفاري في النتيجة. أفادت التقارير أن نسبة الإقبال في الجولة الثانية كانت أعلى من الجولة الأولى.