يوهانا النمساوية (بالألمانية: Johanna von Österreich؛ بالإيطالية:Giovanna d'Austria؛ 24 يناير 1547 – 11 أبريل 1578) هي دوقة توسكانا الكبرى القرينة من خلال زواجها من فرانشيسكو الأول دي ميديشي، وفضلاً عن ذلك هي والدة ماريا دي ميديشي زوجة هنري الرابع ملك فرنسا، وجدة الملك لويس الثالث عشر من فرنسا وإليونورا غونزاغا إمبراطورة رومانية مقدسة القرينة كزوجة الثانية لإمبراطور فرديناند الثاني.
ولدت كأرشيدوقة في النمسا كأصغر ابنة للإمبراطور الروماني المقدس فرديناند الأول وزوجته آنا من المجر وبوهيميا .