ويكيبيديا اليابانية (باليابانية: 日本語版ウィキペディア) هي النسخة اليابانية من موسوعة ويكيبيديا، تم إطلاقها في سبتمبر 2002، وفي يناير 2016 أصبح لديها أكثر من 1000000 مقالة، وترتيبها الخامسة بين الويكيبيديات حسب الحجم. وأكبر الويكيبيديات المكتوبة بلغة غير هندية أوروبية.
اعتبارًا من يونيو 2020، أصبحت ويكيبيديا اليابانية الأكثر زيارة في العالم بعد ويكيبيديا الإنجليزية.