الأوقاف الذرية في القدس، وتُعرف أيضًا باسم الأوقاف الأهلية أو الأوقاف العائلية، هي أوقاف إسلامية يخصص فيها الواقف أصلًا عقاريًا أو ماليًا لمصلحة ذريته أو أقاربه، مع النص غالبًا على انتقال الوقف، عند انقراض المستحقين من الذرية، إلى جهة خيرية أو دينية. وقد شكّل هذا النوع من الوقف أحد المكونات المهمة في تاريخ الملكية العقارية والاجتماعية في القدس، ولا سيما في البلدة القديمة، حيث ارتبط بأسر مقدسية وبمؤسسات دينية وتعليمية واجتماعية.
ازدهرت الأوقاف الذرية في القدس خلال العهدين المملوكي والعثماني، ثم ظلت ذات أثر اجتماعي واقتصادي في عهدي الانتداب البريطاني وما بعده. وتشير دراسات حديثة إلى أن الوقف، بشقيه الخيري والذري، كان من أهم أدوات حفظ العقار داخل العائلات المقدسية، وتنظيم الانتفاع به، ومنع بيعه أو تفتيته بسهولة بفعل الميراث أو الاضطرابات السياسية.