وزارة البحرية الأمريكية هي إحدى الإدارات العسكرية الثلاث التابعة لوزارة الدفاع في الولايات المتحدة الأمريكية. تأسست بموجب قانون صادر عن الكونجرس في 30 أبريل 1798، بناءً على حث وزير الحرب جيمس ماكهينري، لتوفير هيكل تنظيمي حكومي للبحرية الأمريكية. منذ عام 1834، مارست الإدارة سلطتها القضائية على قوات مشاة البحرية الأمريكية، وخلال زمن الحرب على خفر السواحل الأمريكي. تظل هذه الفروع في جميع الأوقات فروعًا مستقلة ومتساوية في الخدمة داخل وزارة البحرية. ويقودها وزير البحرية، وهو ضابط مدني قانوني.
كانت وزارة البحرية وزارة تنفيذية، وكان وزيرها يخدم في حكومة الرئيس، حتى عام 1949، عندما أسست تعديلات قانون الأمن القومي لعام 1947 وزارة الدفاع كوزارة موحدة لجميع الخدمات العسكرية؛ أصبحت وزارة البحرية، إلى جانب وزارة الجيش ووزارة القوات الجوية، مكونًا من وزارة الدفاع، خاضعة لسلطة وتوجيه وسيطرة وزير الدفاع.
من عام 2001 إلى عام 2019، تم تقديم مقترحات لإعادة تسمية وزارة البحرية إلى وزارة البحرية ومشاة البحرية بدعم واسع في الكونجرس الأمريكي، لكنها فشلت بسبب معارضة السيناتور وضابط البحرية الأمريكية السابق جون ماكين.