نهر مانغوكي (الإنجليزية: Mangoky River) نهرٌ يبلغ طوله 564 كيلومترًا (350 ميلًا) في مدغشقر، ضمن منطقتَي أتسيمو-أندرفانا وأنوسي. يتكوّن من التقاء نهرَي مانانانتانانا وماتسياترا، ومن روافده المهمة الأخرى نهر زومانداو.
ينبع النهر من المرتفعات الوسطى في مدغشقر إلى الشرق مباشرةً من مدينة فيانارانتسوا. ويجري عمومًا في اتجاهٍ غربيّ خارجًا من المرتفعات، فيعبر الامتداد الجنوبي من هضبة بيماراها، ثم يبلغ السهل الساحلي ودلتاه، ويصبّ في قناة موزمبيق شمال مدينة مورومبي عند الإحداثيّات 21.32° جنوبًا و43.53° شرقًا.
تعرّض معظم مدغشقر لإزالة غاباتٍ خطيرة خلال العقود الأربعة الأخيرة، معظمها بسبب ممارسات القطع والحرق لدى السكان الأصليين. وقد أدّى فقدان الغابات هذا إلى تعريةٍ شديدة للتربة في حوض نهر مانغوكي، كما تشهد على ذلك كثرة الضِّحاح الرملية داخل مجرى النهر. وتقع بحيرة إيهوتري المُحمّلة بالطمي جنوب النهر بوضوح. أما الجزء الجنوبي من الدلتا فتهيمن عليه الجزر الحاجزة وتشكيلات الألسنة الرملية المتعاقبة، في حين تسود أشجار المانغروف والمداخلُ المدّية الجزءَ الشمالي المحميّ من الدلتا.