نظام فهرسة المواضيع الطبية (بالإنجليزية: Medical Subject Headings) وتُختصر إلى MeSH هو نظام شامل لغرض فهرسة مقالات الدوريات والكتب في مجال علوم الحياة. وهو بمثابة قاموس المرادفات الذي يسهل البحث. تم إنشاؤه وتحديثه بواسطة المكتبة الوطنية الأمريكية للطب NLM، ويتم استخدامه بواسطة قاعدة بيانات مقالات مدلاين ومحرك بحث ببمد وكتالوج المكتبة الوطنية الأمريكية للطب لمقتنيات الكتب. يتم استخدام نظام فهرسة المواضيع الطبية أيضًا بواسطة موقع التجارب السريرية لتصنيف الأمراض التي تمت دراستها من خلال التجارب المسجلة في الموقع.
تم تقديم نظام فهرسة المواضيع الطبية في الستينات، مع كتالوج فهرس المكتبة الوطنية الأمريكية للطب الخاص وعناوين الموضوعات للفهرس الطبي التراكمي الفصلي (إصدار 1940). تم إيقاف النسخة المطبوعة السنوية من نظام فهرسة المواضيع الطبية في عام 2007 وأصبح نظام فهرسة المواضيع الطبية متاحًا الآن عبر الإنترنت فقط. يمكن تصفحها وتنزيلها مجانًا من خلال محرك بحث ببمد. في الأصل باللغة الإنجليزية، تمت ترجمة نظام فهرسة المواضيع الطبية إلى العديد من اللغات الأخرى ويسمح باسترجاع المستندات من أصول مختلفة.