نظام تصنيف الفيفا للرجال (1999-2006) (بالإنجليزية: 1999–2006 FIFA men's ranking system) كان تقنية حسابية استخدمها الاتحاد الدولي لكرة القدم (الفيفا) سابقًا لتصنيف المنتخبات الوطنية للرجال في كرة القدم. قُدّم هذا النظام من قبل الفيفا في عام 1999، كتحديث لنظام سابق، ثم استُبدل بنظام مُبسّط بعد كأس العالم 2006.
كان التصنيف مشابهًا بشكل أساسي لنظام الدوري، وإن كان على نطاق أوسع وأكثر تعقيدًا. كان بإمكان كل فريق حصد عدد معين من النقاط في كل مباراة، ومع أن عدد النقاط الممنوحة في نظام الدوري يعتمد فقط على نتيجة المباراة، إلا أنه في تصنيفات الفيفا، كان لا بد من مراعاة عوامل أخرى، إذ أن كل فريق لا يلعب أمام جميع الفرق الأخرى ذهابًا وإيابًا كل موسم، كما في معظم أنظمة الدوري. بعد منح النقاط، تُرتب الفرق تنازليًا حسب عدد النقاط، حيث يكون الفريق الحاصل على أكبر عدد من النقاط هو الأعلى تصنيفًا.
لم تعتمد النقاط المخصصة فقط على فوز الفريق أو خسارته أو تعادله، بل اعتمدت أيضًا على أهمية المباراة وقوة الخصم. يُحتسب الفوز على خصم ضعيف بعدد نقاط أقل من الفوز على خصم أقوى بكثير. هذا يعني أن المباراة لن تُحتسب بنقطتين أو ثلاث نقاط للفوز ونقطتين للتعادل، كما هو معتاد في معظم مباريات الدوري الوطني. كان الحساب أكثر تعقيدًا نظرًا لضرورة مراعاة العوامل الأخرى المذكورة آنفًا.