حلقات الموسم الثاني من ناروتو شيبودن أخرجها هاياتو داتي وأنتجها إستديو بيرو وتلفاز طوكيو. الموسم مبني على الجزء الثاني من مانغا ناروتو للمؤلف ماساشي كيشيموتو. عنوان الموسم هو اللقاء المنتظر طويلاً (遥かなる再会، هاروكانارو سايكاي) الموسم يتتبع قصة النينجا المراهق ناروتو أوزوماكي والذي وُكِّل إلى فريقه مهمة إيجاد رفيقهم ساسوكي أوتشيها الذي هجر قريتهم للتمرن مع المجرم أوروتشيمارو. عُرض الموسم على تلفاز طوكيو في اليابان من 8 نوفمبر 2007 حتى 3 أبريل 2008. أُصدر الموسم بعدئذٍ على أقراص دي في دي من 8 أبريل حتى 8 أغسطس من العام 2008 بواسطة أنيبلكس.
استخدم الموسم أغنية بداية وأغنيتي نهاية. أغنية البداية هي «مسافة» بواسطة لونغ شوت بارتي. أغنيتا النهاية كانتا "قصتك" (キミモノガタリ، كيمي مونوغاتاري) بواسطة ليتل باي ليتل التي تظهر في الحلقات من 31 حتى 41، والثانية هي "متيقظ! بري" (目覚めろ!野性، ميزاميرو! ياسي) بواسطة ماتشي و«كويسشن؟» والتي تظهر في الحلقات من 42 حتى 53.