نائب رئيس جمهورية بوروندي (بالانجليزية: vice-president of the Republic of Burundi) هو منصب سياسي رفيع في الحكومة البوروندية، يُعد بمثابة النائب الدستوري لرئيس الجمهورية. أُنشئ المنصب في يونيو عام 1998 بموجب الدستور الانتقالي الذي تم اعتماده كجزء من الجهود الرامية إلى إعادة الاستقرار السياسي والعرقي إلى البلاد، في أعقاب الحرب الأهلية التي اندلعت في تسعينيات القرن العشرين.
حل هذا المنصب محل منصب رئيس الوزراء، الذي تم إلغاؤه في نفس الفترة، ليصبح نائب الرئيس المساعد الرئيسي لرئيس الدولة في تسيير شؤون البلاد.