يتكون مناخ باراغواي من مناخ شبه مداري في منطقة باراناينسي، ومناخ مداري وشبه جاف في منطقة غران تشاكو. وتتميز منطقة باراناينسي بمناخ رطب، مع هطول أمطار غزيرة طوال العام وتغيرات موسمية معتدلة فقط في درجات الحرارة. تكون الفصول في باراغواي معاكسة لتلك الموجودة في نصف الكرة الشمالي، مما يعني أن الصيف الشمالي يقابله الشتاء الباراغواياني، والعكس صحيح.
خلال فصل الصيف، يكون المؤثر المهيمن على المناخ هو رياح السيروكو الدافئة التي تهب من الشمال الشرقي. أما خلال فصل الشتاء، فتكون الرياح السائدة هي رياح البامبيرو الباردة القادمة من جنوب المحيط الأطلسي، والتي تهب عبر الأرجنتين وتنحرف نحو الشمال الشرقي بفعل جبال الأنديز في الجزء الجنوبي من ذلك البلد. ونظرا لعدم وجود حواجز تضاريسية داخل باراغواي، فإن هذه الرياح السائدة المتعاكسة تؤدي إلى تغيرات مفاجئة وغير منتظمة في الطقس المعتدل عادة، وتكون الرياح نشطة بشكل عام. وقد سجلت سرعات وصلت إلى 160 كيلومترا في الساعة في المواقع الجنوبية، كما تعرضت مدينة إنكارناسيون للدمار في إحدى المرات بسبب إعصار قمعي.